Большинство приобретенных кист происходит из проксимальных канальцев нефрона и содержит один слой кубического эпителия – т.е. стенка кисты выстлана эпителиальными клетками, имеющими кубическую форму, встречаются также атипичные кисты, характеризующиеся наличием многослойной эпителиальной выстилки. Как правило, эти кисты образуются из кист с однослойным эпителием. 

Содержимое простой кисты почки по биохимическому составу похоже на плазму крови, в то время как состав кист, ассоциированных с поликистозной болезнью почек, близок к составу мочи.

Жидкость в простой кисте почки, как правило, всегда прозрачна, желтоватого цвета. Оттенок может варьировать от ярко-желтого до почти прозрачного.

Также могут встречаться геморрагические кисты почки. Они могут быть результатом кровоизлияния в полость простой кисты почки. Типичная простая киста почки – это образование округлой формы с четкими границами и плотностью до 15 HU, не накапливающее контрастное вещество. Содержимое кисты почки геморрагического характера способствует увеличению ее плотности и при компьютерной томографии киста может иметь плотность близкую к плотности почечной паренхимы. Нередко такие результаты компьютерной томографии могут интерпретироваться как какое-то однородное образование. Однако проведение компьютерной томографии с контрастированием решает вопрос дифференциальной диагностики, так как геморрагическая киста не накапливает контраст, в отличие от солидного образования. 

Существует мнение, что полученное при пункции содержимое кисты почки, окрашенное кровью, говорит о наличии злокачественной опухоли в полости кисты. Однако данное убеждение не совсем верно, так как окрашивание содержимого кисты кровью может быть обусловлено повреждением сосуда при пункции кисты. В данном случае врач иногда руководствуется цветом примеси, для того чтобы понять свежая ли эта кровь или нет. Если примесь крови имеет характерный бордовый цвет, врач с большей долей вероятности может заподозрить раковый процесс в кисте почки. Окончательные выводы врач сделает после биохимического и цитологического исследования полученной жидкости.

Сложные кисты могут быть заполнены отложениями кальция, кроме того в их полости могут обнаруживаться тканевой компонент. Наличие в полости кисты тканевого компонента является неблагоприятным признаком, свидетельствующем о высоком риске озлокачествления кисты почки.