Сами по себе кисты болей вообще не вызывают. Но оперированная почка "имеет право" болеть по разным причинам. Кроме того, удаление камня не значит излечение от мочекаменной болезни и, как следствие - хронического калькулёзного пиелонефрита. Эти состояния вообще никуда никогда не денутся. Боли может вызывать нарушение уродинамики вследствие отхождения кристаллов солей, к примеру. Делайте УЗИ почек 1 раз в 3 месяца, наблюдайтесь у уролога.