Без очного осмотра и обследования сложно ответить на Ваш вопрос. Обратитесь к дерматовеерологу/урологу для осмота и обследования.
Судя по описанию, может быть папиллома уретры, уретрит.
1. Лечение ведется правильно.
2. Причин у цистита крайне много: чаще всего - инфекции.
3. Нет нельзя. Половой покой должен длиться 2 - 3 неделеи после лечения.