Инстилляции категорически нельзя делать на фоне обострения цистита, тем более беременным. Предупредите своего доктора о том, что Вы не принимали Амоксиклав. Если Вы боитесь принимать это препарат, то Вам заменят его на менее токсичный, хотя Амоксиклав и не противопоказан при беременности.

Вам надо сейчас, вне обострения, сдать мочу на бакпосев и чувствительность к антибиотикам. Далее решение принимать с наблюдающим акушер-гинекологом.