1. Такое может быть по многим причинам, например, Вы устойчивы к этому возбудителю, возникла лабораторная ошибка, Вы находитесь в инкубационном периоде, ошибка диагностики у супруга и т. п.
2. Либо половым путем, либо при рождении от матери.
3. Супруга следует пролечить, а Вам следует повторно выполнить анализ (мазок методом ПЦР) через месяц. Дальнейшие действия исходя из результатов анализа.