При лечении интерстициального цистита принято придерживаются тактики от консервативного и более дешевого метода лечения к инвазивному. Следует начать с поведенческой терапии, и, если это не поможет, то перейти к фармакологическому лечению, а затем к инстилляциям в мочевой пузырь. В случае неэффективности всего вышеперечисленного, применяют такие методы, как гидродистензия, чрескожная электростимуляция, инъекции в мочевой пузырь ботулотоксина, оперативное увеличение мочевого пузыря, отведение мочи (в крайнем случае). Иногда применяют и более редкие методы (например, периферическая денервация).

Гидродистензия иногда помогает.