Здравствуйте! Если данные достоверны, скорее всего имело место бессимптомное носительство. При "встрече" с кишечной микрофлорой, местный иммунитет "упал", выявились скрытые возбудители. Я бы посоветовала пересдать уретральный соскоб на "андрофлор". Супруге надо тоже обследоваться у гинеколога. Удачи!