Судя по описанию, нельзя исключить варикоцеле, эпидидимит или простатит. Вам показана очная консультация уролога и обследование: четырехстаканная проба (посев + микроскопия), мазок на половые инфекции и УЗИ мочевого пузыря, простаты и органов мошонки.
Наличие сгустков и комочков в сперме патологией не является.