А какой конкретно диагноз Вам поставили?
Анализы на сифилис могут оставаться на всю жизнь положительными (особенно специфические).
Только при лечении позднего сифилиса (и нейросифилиса) показано 2 курса лечения. Для остальных форм сифилиса достаточно одного курса лечения.