В течение первых 10 недель после зачатия малыш в матке называется эмбрионом. Данный период очень важен для развития органов. По прошествии этого времени и до момента рождения ребенок называется уже плодом. Во время нахождения плода в матке функцию почек выполняет плацента, связывающая маму и малыша. Однако после рождения младенцу крайне необходимы собственные хорошо работающие почки.

Часть почки, где продуцируется моча (паренхима), и транспортная система развиваются из разных источников. Паренхима образуется в паховой области эмбриона и перемещается вверх, где должна соединиться с транспортной системой в правильном месте в нужное время. Первая моча образуется на 11-й неделе внутриутробного развития плода. Нарушение миграции может привести к образованию подкоовообразной почки или эктопии почки (расположению в неправильном месте). Изменения формирования и развития зачатка мочеточника могут привести к удвоению мочевых путей, уретероцеле, эктопии мочеточника и пузырно-мочеточниковому рефлюксу. Если нарушается процесс соединения паренхимы и мочеточника, почка становится нефункциональной и представляет собой множество кист.