Вячеслав, понимаю Вашу ситуацию и беспокойство. 

Если у Вас есть жжение в уретре, это действительно повод для немедленного обследования на негонококковый уретрит. Основные возбудители - Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis. Для диагностики сейчас золотым стандартом считается ПЦР-исследование первой порции мочи или уретрального мазка.

Что касается Вашего вопроса - половой акт с постоянной партнёршей три дня назад никак не повлияет на достоверность ПЦР-диагностики. Главное условие для правильного забора материала - не мочиться минимум два часа до анализа. Сам факт полового акта не снижает чувствительность теста, поэтому результат будет объективным.

Если Вы живёте только с одной партнёршей и у Вас нет других половых контактов, риск «наложения» новых инфекций минимален. Но важно помнить, что если партнёрша тоже инфицирована и не пролечена, Вы оба можете друг друга постоянно «реинфицировать», даже если это один и тот же возбудитель. Поэтому обследование и при необходимости лечение должны проходить оба одновременно.

С момента появления симптомов (жжение) и до завершения лечения, а также получения отрицательного контрольного теста, рекомендуется полностью воздерживаться от половых контактов. Иначе лечение будет неэффективным, и инфекция может перейти в хроническую форму или вызвать осложнения.

Резюмируя: сдавайте анализ сейчас, соблюдая двухчасовой интервал после мочеиспускания - результат будет достоверным. Но не откладывайте обследование и обязательно обсудите с партнёршей необходимость совместного обследования и лечения. Это важно для полного выздоровления и предотвращения повторных заражений.