Добрый день!
Если инфекция высеяна в кале, то маловероятно, что на она связана с болями в почках, покраснением уретры.
Если это Вас беспокоит, то Вам надо пройти обследование:
1) Общий анализ мочи
2) УЗИ почек, мочевого пузыря, простаты с определением остаточной мочи
3) Анализ соскоба из уретры