Уважаемая Елена!
1. КТ и МРТ в Вашем случае показаны для исключения онкологических процессов, т.к. цистит (обычный цистит) не может длиться полгода.
2. КТ и МРТ безвредны.
3. Нельзя утверждать, что каким-то методам можно доверять, каким-то - нет. Для каждого из методов (УЗИ, цистоскопия, КТ, МРТ) есть свои показания, они не заменяют друг друга, а дополняют.
Удачи.