Тот или иной метод лечения при болезни Пейрони подбирают в зависимости от многих факторов, наиболее важными из которых являются: возраст пациента, наличие боли, наличие эректильной дисфункции, размер бляшки, наличие кальцинатов в ней, степень искривления полового члена и длительность заболевания. В зависимости от этих факторов подбирают наиболее подходящий метод лечения: консервативное лечение (пероральные препараты, инъекционные препараты, электрофорез), "дробление" бляшки и оперативное лечение. Наиболее эффективным, как правило, является оперативное лечение.