Уважаемый Виктор! Суть образования кальцинатов та же – воспаление, уплотнение экссудата и образование кальцината. Как правило, кальцинат, как и киста размерами 3 мм, не вызывает болей или неприятных ощущений. Но они могут поддерживать воспалительный процесс в придатке яичка и самом яичке, который может вызывать дискомфорт. Можно рекомендовать сдать посев эякулята на флору и чувствительность к антибиотикам (т. к. у Вас ранее имел место стафилолокк), обследоваться на ЗППП, провести этиологическое лечение (т. е. направленное на причину, т. е. на инфекцию). Это лечение не удалит кальцинаты, но сопутствующий воспалительный процесс может купировать. Выздоравливайте.