Уважаемый Сергей!
1. По поводу МКБ: камни размерами 1 см самостоятельно не отойдут, их надо удалять. В данной ситуации возможно применение дистанционной литотрипсии (ДЛТ), но только после купирования обострения хронического пиелонефрита. Вам надо обратиться к урологу, выполнить посев мочи на флору ичувствительность к антибиотикам, по результатам которго будет назначена адекватная антибактериальная терапия, и экскреторная урография. Последнее обследование необходимо для уточнения размера камня, его точной локализации в почке, определения степени нарушения оттока мочи, и т.д. Этм данные потребуются для выполнения ДЛТ.
2. По поводу запаха: "рыбный" запах могут давать гарднереллы. Сдайте анализы на ЗППП (11 инфекций).
Удачи.