Уважаемая Марина! Цистит не протекает с температурой 40 гр.Вероятнее всего, это был острый пиелонефрит. Это серьезное состояние, Вам надо обследовать дочку у уролога. Необходимо выполнить  общий анализ мочи, посев мочи на флору, УЗИ почек и мочевого пузыря. После чего можно будет определиться  с лечением. Не откладывайте визит к урологу. Удачи.